Начнём поиск корня в прилагательном мужского рода «чёрный» с морфемного анализа. Прежде всего выделим окончание. Для этого мы посмотрим, как представлена лексема в косвенных падежах: чёрному, чёрного. Изменяется «ый» – это и будет окончание. Затем отбросим изменяемую часть и получим основу «черн».
Для точного определения корневой морфемы подберём однокоренные слова, которые представлены большим количеством примеров. Например, черновик, чернеть, чернорабочий, почернелый, черноусый, начерно и т.д. Во всех словах этого ряда есть общая часть «чёрн», в которой и хранится основное значение – название цвета. Чередование ударного Ё с безударным Е смысла не меняет.
Значит, корень в слове – «чёрн».
Отметим, что при подборе однокоренных лексем нужно учитывать особенность анализируемого слова – его многозначность.